Generika weisen im Allgemeinen eine einfache Molekülstruktur auf. Biosimilars sind in ihrer Struktur deutlich größer und komplexer. Ein monoklonaler Antikörper wie Natalizumab besteht beispielsweise aus etwa 20.000 Atomen. Zum Vergleich: Das chemische Arzneimittel Dimethylfumarat hat nur 15 Atome.
Eine besondere Wirkstoffklasse sind die so genannten NBCDs (Non-Biological Complex Drugs), zu denen unter anderem Glatiramerazetat zählt. Sie werden wie Generika chemisch-synthetisch hergestellt, ihre Moleküle sind aber deutlich komplexer.