Antikörper sind sehr komplexe Eiweiße (Proteine). Der Grundaufbau ist bei allen Antikörpern gleich. Das Molekül hat die Form eines Y. Jeder Teil des Moleküls ist für eine andere Aufgabe zuständig:

• Mit dem vorderen Teil der beiden Arme (sog. variablen Anteil) binden sie gezielt an ein Antigen von Erregern, Zellen oder Fremdstoffen. So können zum Beispiel Viren für andere Immunzellen markiert und unterschädlich gemacht werden.
• Der Stamm (sog. konstanter Anteil) interagiert mit anderen Komponenten des Immunsystems, beispielsweise mit einer „Fresszelle“ (Makrophage).